Müzenin temaları, kültürel, sosyal ve ekonomik, yapılı ve doğal çevre ana bölümlerinden oluşur.
Müze’de bu temalar tarihsel bir perspektifle anlatılır. Müze’de her temada, tarihte kapladığı yerden bağımsız olarak, ikincil kişiler ve kültürler işlenir. Çorlu’nun en önemli özelliği olan göç alan, dinamik ve çok kültürlü geçmişi anlatılır.